مسجد جامع زهان در طول دوره های تاریخی تحت تاثیر دو عامل زلزله و سیل چندین مرتبه تخریب و بازسازی شده است كه آخرین بار در سال ۷۶براثر زلزله ویران گردید.بنای اولیه این مسجد د ردوره صفویه احداث گردیده است. موقعیت آن در بخش میانی زهانی و در جوار رودخانه واقع شده شكل و فرم پلان آن بامسجد جامع قاین و افین تفاوت دارد.دارای یك ایوان رفیع و دو غرفه در اطراف آنست .شبستانی ندارد درب ورودی از ضلع شمال غربی بوده و ایوان رفیع آن گچكاری شده و بر بالای ایوان تاریخی از گچكاری سال ۱۳۲۲ه.ق مشهود است. در انتهای ایوان محرابی ساده دارد مصالح ساختمانی در پاكار از سنگ وملات و ساروج و آجر وگچ با تركیبی از گل می باشد. در میان دیوارها قطعات فراوانی از چوب بكار رفته تا استحكام ساختمان را بیشترنماید.در اطراف صحن تعدادی غرفه جهت عبادت و استراحت مومنین بوده است.درطرف راست ایوان بزرگ كتیبه وقفی نصب شده كه تاریخ آن مربوط به سال ۱۲۸۱ه.ق است. مضمون آن پیرامون موقوفه ای از وقف آقا رضا ابن حسن خان می باشد.آب انباری نیز در جوار مسجد قرار داشته كه آب شرب مورد نیاز را تامین می نمود.تعداد ۶مغازه متعلق به مسجد در دو طرف درب ورودی وجود داشته كه به اجاره داده می شد و در آمد آن صرف امور مسجد می گردید.مدرسه علمیه حمام و كاروانسرای بزرگ زهان در جوار مسجد قرار داشتند اینجا محل جنب وجوش و ازدحام جمعیت بود در حقیقت مجموعه ای از پدیده های جغرافیائی شامل عنصر مذهبی تجاری و رفاهی از سیمای كالبدی فرهنگی زهان قدیم را شكل می داد. تعداد زیادی از موقوفات منطقه زهان وقف بر این مسجد بود.۲۰۰سال قبل فرد خیری بنام بكابلی از اهالی بشیران كه در افغانستان سمت درباری داشت پولی فرستاد تا ایوانی به طرح مسجد گوهر شاد برای مسجد جامع زهان بسازند. این كار توسط میرزا محمد حسین قاصر انجام شد. اما بعد از اتمام كار كه وی از محل بازدید نمود گویا این ساخته شده مورد پسند وی واقع نشد.