در دوران سلطنت محمدعلی شاه و احمدشاه، از این مدرسه كه یك بنای خشتی بوده به عنوان مكتب استفاده می شده و توسط آخوند ملاجواد به بچه های بیله سوارقرآن و سایر علوم تدریس می گردید.در اواخر سلطنت احمدشاه مدرسه خشتی قدیمی تخریب و مدرسه موجود با معماری یاور ماكوئی كه از مرزبانان منطقه بوده است، این مدرسه بنام مدرسه پهلوی ، سالها طالبان علم و دانش بیله سوار و نواحی اطراف آنرا به خود جذب كرده و عطش آنان را سیراب نموده است مدرسه پهلوی بعد از پیروزی انقلاب اسلامی به مدرسه آمام خمینی تغییر نام یافته و خوشبختانه ساختمان قدیمی این مدرسه هنوز هم سالم مانده و امروز عنوان قدیمی ترین بنای آموزشی استان اردبیل و منطقه مغان را یدك می كشد. و جزوء آثار تاریخی و دیدنی شهر می باشد. هزینه ساخت این مدرسه از خودیاری مردم تامین شد.و سرگرد یاور دوستعلی ماكو رییس مرزبانی درجه یك مغان كه آن زمان در بیله سوار مستقر بود مهندسی این مدرسه را انجام داد. این بنا در تاریخ ۸۱/۱۲/۱۷ تحت شماره ۷۵۱۷ به ثبت رسیده است وكد اثر ۱۸۰۴۰ می باشد. بنای ثانویه مدرسه بیله سوار در محل قدیمی تر با سنگ پی ریزی شده، كلیه هزینه ساخت دبستان توسط اهالی منطقه تأمین و با یاری ساكنین بیله سوار احداث گردید. این بنا دارای تزئینات آجری زیبایی در نما بصورت هره سازی، دوال بندی، نقوش هندسی بسیار زیبا با استفاده از آجرهای دو سر پخ (ذوزنقه) و قاب بندی آجری در و پنجره ها می باشد. مدرسه در ابتدای خیابان امام جنب پاسگاه قدیمی شهرستان بیله سوار قرار دارد.