بقعه سید اسماعیل از بقعه های متعلق به دوره قاجاریه است كه بنای امروزی آن از دوره محمد شاه به جا مانده است. كتیبه و ایوان و رواق حرم مربوط به دوره قاجار است. در قسمت بالای مرقد سید ، درب منبت كاری شده ای وجود دارد كه روی این درب، كتیبه زیبایی وجود دارد. كتیبه های دیگری نیز به خط نسخ برجسته، بالای درب وجود دارد كه تاریخ آن جمادی الاول سال ۸۸۶ هجری قمری است (زمان آق قویونلو) كه ظاهرا قدیمی ترین تاریخی است كه در بناهای كهنه تهران دیده می شود.