از دیگر مساجد نائین مسجد شیخ مغربی است . پژوهشگرانی كه در مورد نائین بررسی های انجام داده اند به نام این مسجد اشاره كرده اند اما ازتاریخ دقیق قدمت آن مطلب مهمی ننوشته اند . این مسجد در بازار نائین واقع شده است. مسعود كیهان این مسجد را( شیخ محمد ربیع ) نوشته كه البته اشتباه است . بانی مسجد شیخ مغربی ازعرفا و زهاد نایین بوده كه به نوشته كتاب سیمای نائین در گنبد خانه مسجد مدفون است به نوشته این كتاب بر سر در بقعه شیخ مغربی این بیت دیده می شود كه شیخ مغربی از عارفین است مقام و مدفنش نائین زمین است از جمله كسانی كه در عمران وآبادی این مسجد خدماتی انجام داده اند فردی به نام سید حسن بوده كه از فضلای مشهور نایین به شمار می رفته است .