مقیم سیاسی در قرن نوزدهم و چندین كنسولگری اروپایی با توسعه خرمشهر توسط دولت ایران در دهه‌های ۱۹۶۰ و ۷۰ به عنوان بندر اصلی برای نفت، اهمیت تجاری آن كاهش یافت. خلیج فارس بندر بوشهر همچنان به عنوان بندر خدمت می‌كند، هرچند كه توسط بندرعباس و بندر امام خمینی (بندر شاهپور سابق) تحت الشعاع قرار گرفته است. بندر بوشهر دارای یك لنگر بیرونی عمیق اما آشكار و یك لنگر داخلی است. از طریق جاده به بندرخمینی و بندرعباس و سایر شهرها متصل است. همچنین از طریق هوا و جاده از طریق شیراز و اصفهان به تهران مرتبط است.
بندر بوشهر در حال حاضر مركز منطقه‌ای توزیع نفت، دارای دانشكده اعطای مدرك و مركز شیلات است. ایجاد یك نیروگاه حرارتی در آنجا باعث تشویق رشد صنایع فرآوری مواد غذایی و مهندسی شد. میوه‌های خشك، صمغ، قالیچه و پنبه خام صادر می شود. این شهر در دهه ۱۹۸۰ در جنگ ایران و عراق آسیب زیادی دید اما در دهه ۱۹۹۰ تا حد زیادی بازسازی شد.