این بنا در سمت چپ ایوان قرار دارد و ظاهراً نام آن منسوب به سازنده بنا (خواجه زكی بن محمد بن مسعود كرمانی) است. مسجد كرمانی با ابعاد۱۷×۷۰/۱۰متر مشتمل بر شاه نشین در وسط هر ضلع و سه چله خانه در زوایای شرقی و غربی است كه در شاه نشین واقع در ضلع غربی زیبا ترین عنصر معماری این مسجد یعنی محراب گچ بری و نفیس آن از شاهكارهای قرن هشتم هجری ساخته شده است.بر ازاره دیوارها نیز یك رشته كتیبه عالی نقش بسته و بر اسپرها قاب های مشبك گچبری تعبیه شده كه حكایت از مهارت و درایت هنرمندان آن است. شاه نشین های واقع در زوایای جنوبی و شمالی دارای پوشش نیم گنبدی بوده وجود تاق و تویزه ،ایجاد گنبد بر روی آن ها را ممكن نموده است .