رودخانه شور بهاباد در شمال شهرستان بهاباد یزد واقع شده است و علت شكل گیری آن قرارگیری بر روی یك گسل فعال در این منطقه می باشد.رودخانه ی زیبای شور در شهرستان بهاباد با طول ۱۱ كیلومتر از جنوب كوه های آسفیچ و بنستان به شمال دشت كویر امتداد دارد و عرض آن در قسمت های مختلف به علت تغییرات دیواره ای متفاوت می باشد.آبدهی متوسط آن نیز ۸۵ لیتر در ثانیه است.رودخانه ی شور تنها رودخانه ی دائمی بهاباد در تمام طول سال آب دارد و در مسیر عبور خود به سمت كویر، طبیعتی جالب و دیدنی خلق كرده است.
پوشش گیاهی(نبكا) و سرزمین های اطراف رودخانه شوربهاباد نیز از نظر زمین شناسی و جغرافیایی بسیار حائز اهمیت می باشد، به گونه ای كه كویرنوردی در اطراف رودخانه شور بسیار شورانگیز و خاطره ساز است.
رودخانه شور تمبرگز بهاباد:
شهر تاریخی بهاباد علاوه بر رودخانه شوربهاباد، رودخانه ی دیگری به نام رودخانه شورتمبرگز بهاباد نیز دارد كه ۱۵ فرسنگی كویر بهاباد واقع شده است.از عجایب رودخانه ی شور تمبرگز بهاباد این است كه در دل آن یك چشمه آب شیرین به اندازه یك ظرف ۵ لیتری در حال فوران و جوش و خروش می باشد و بیابان گردان از آن به عنوان آب نوشیدنی استفاده می كنند و بسیار جالب و تماشایی است.
جاهای دیدنی بهاباد
مقبره شیخ محمد، خانه سنگی بهاباد(منزل آل طاها بهاباد)، درخت كهنسال كاج وحشی روستای بنستان، درخت ۱۲ امام و چنار ۳۰۰۰ ساله آسفیچ، سرو كمكوئیه، بافت پلكانی روستای زیركوئیه، ۱۰ چشمه آب آسفیچ، موزه علوم طبیعی و مردم شناسی بهاباد، مجموعه تاریخی جنت آباد، تپه باستان تل با سنگ نگاره هایی از مردمان پیش از تاریخ و … برخی از اماكن تاریخی و دیدنی شهرستان بهاباد می باشد.
كویر شرقی بهاباد به همراه منطقه ی نای بندان نیز از بكرترین و دیدنی ترین كویرهای ایران به شمار می رود.