مسجد امامزاده محمد (بسطام) این بنا بین امامزاده محمد و مسجد سلجوقی، در مجموعه تاریخی بایزید بسطامی واقع است . از ظواهر امر پیداست كه ابتدا به صورت حیاط كوچكی بوده؛ ولی در زمان قاجاریه آن را پوشانده اند . طبق كتیبه موجود، این بنا در سال ۱۲۴۲ ه- . ق زمان فتحعلی شاه قاجار- تعمیر شده است . در ضلع جنوبی مسجد، سه در كنده كاری شده دیده می شود كه رابط بین این قسمت و مسجد سلجوقی است . بر گردا گرد دیوار مسجد، آیاتی از قرآن گچبری شده است . ضلع غربی مسجد به واسطه یك محوطه مربع كوچك، به مسجد زنانه ایلخانی مربوط می شود . این مسجد، دو راه به بیرون دارد ؛ یكی به كوچه پشت مسجد و دیگری به رواق حرم امامزاده محمد . بر روی در طرف كوچه، منبت كاری نسبتا زیبایی به چشم می خورد؛ ولی به ظرافت درسه لنگه مسجد نیست .