قائِن یا قایـِن یكی از شهرهای استان خراسان جنوبی و مركز شهرستان قائنات در ایران است. قائن به خاطر زعفران مرغوب آن دارای شهرت است. شهر قائن كه در گذشته دارای برج و بارو، كهندژ، خندق و ارگ بوده، به همراه تون (فردوس امروزی) از شهرهای مهم ایالت قهستان محسوب می‌شده‌است.
پیشینه
بر اساس آخرین یافته‌های باستان‌شناسی سابقه سكونت در شهر قائن به دوران پارینه سنگی میانی (حدود ۳۰ هزار سال قبل) می‌رسد. بر اثر حفاری‌های باستان‌شناسی هیئت آمریكایی در غار خونیك در جنوب این شهر، تعدادی دست افزارهای سنگی مربوط به دوران پارینه سنگی میانی در این غار به دست آمد كه از لحاظ مطالعات باستان‌شناسی و انسان‌شناسی بسیار حائز اهمیت است. همچنین وجود تعداد زیادی تپه‌های باستانی در اطراف شهر قائن كه بر اساس مشاهدات اولیه از دوران پیش از تاریخ دارای آثار و نشانه‌هایی است كه قدمت طولانی سكونت در این منطقه از كشور ایران را اثبات كرده‌است.
نقل است كه شهر قائن را كی لهراسپ پدر گشتاسب ساخته‌است. ماركوپولو در سفرنامه خود از این ناحیه به نام «تونوكاین» نام برده‌است كه این نام از نام دو شهر بزرگ ایالت قهستان كه تون (فردوس امروزی) و قائن باشند گرفته شده‌است. همچنین درسال ۴۴۴ هـ.ق ناصرخسرو قبادیانی از این شهر دیدن كرده و از استحكامات شهر و مسجد جامع آن یاد كرده‌است. ایالت قهستان، هم‌زمان با ورود اعراب به ایران، پناهگاه زرتشتیانی بود كه به آن پناه آورده بودند. حمدالله مستوفی، در قرن هشتم هجری از مركزیت قائن نسبت به آبادی‌های دیگر قهستان، و همچنین از فراوانی زعفران و میوة آن گزارش داده‌است. یكی از مهم‌ترین آثار تاریخی قائن, مسجد جامع آن است كه از بناهای قرن هشتم هجری می‌باشد.
آثار باستانی
آخرین بررسی‌ها در شهر قائن به شناسایی ۱۷۰ اثر منجر شده است. این آثار شامل تپه‌ها و محوطه‌های باستانی، قلعه‌ها، مساجد، مقابر و آرامگاهها، خانه‌های تاریخی، درختان كهنسال، غارها، پناهگاه‌های سنگی و دژهای زیرزمینی است.
بیشترین تراكم آثار مربوط به قرون میانه اسلامی بخصوص قرن پنجم (اواخر سلجوقی) تا قرن هشتم (تیموریان) است به شكلی كه اكثر تپه‌ها و محوطه‌های باستانی و قلعه‌های كوهستانی و بسیاری از غارها دارای آثاری از این دوران است. «وجود رشته كوههایی كه دارای ساختار آهكی است در منطقه، باعث بوجود آمدن تعداد فراوانی غار در مناطق مختلف شهرستان قائن شده است.»
غارهای شناسایی شده بیشتر در مناطق مركزی شهرستان پراكنده‌اند. علاوه بر شگفتیهای طبیعی كه این غارها دارند وجود نشانه‌هایی از آثار تاریخی بخصوص وجود آثار معماری در بسیاری از غارها، آنها را به یكی از جاذبه‌های مهم تاریخی و گردشگری منطقه تبدیل كرده و از این نظر دارای استعدادهای بالقوه فراوانی است. همچنین این بررسی ها به شناسایی ۴۰ قلعه تاریخی در این شهر منجر شد. بیشتر این قلعه‌ها در زمان اسماعیلیان (۱۰۰۰ سال پیش) ساخته شده و كاربرد نظامی داشته‌اند. قدمت بقیه قلعه‌ها به دوران ساسانی (۲۰۰۰ سال پیش) و سلجوقیان (هم‌زمان با اسماعیلیان) باز می‌گردد.
بر اساس آخرین یافته‌های باستان‌شناسی سابقه سكونت در شهر قائن به دوران پارینه سنگی میانی (حدود ۳۰ هزار سال قبل) می‌رسد.
